Nächste Schritte¶
KI-gestützte Übersetzung - mehr erfahren & Verbesserungen vorschlagen
Nochmals herzlichen Glückwunsch zum Abschluss des Nextflow For RNAseq Trainingskurses und vielen Dank für das Ausfüllen unserer Umfrage!
1. Die 3 besten Wege, deine Nextflow-Fähigkeiten zu verbessern¶
Hier sind unsere drei wichtigsten Empfehlungen, was du als Nächstes tun kannst, basierend auf dem Kurs, den du gerade abgeschlossen hast.
1.1. Nextflow auf andere wissenschaftliche Anwendungsfälle anwenden¶
Schau dir die Seite Nextflow for Science an für eine Liste weiterer kurzer eigenständiger Kurse, die zeigen, wie du die grundlegenden Konzepte und Mechanismen aus Hello Nextflow auf gängige wissenschaftliche Anwendungsfälle anwenden kannst.
Wenn du dein Fachgebiet nicht durch einen passenden Anwendungsfall vertreten siehst, lass es uns im Community-Forum wissen, damit wir es auf unsere Entwicklungsliste setzen können.
1.2. Mit nf-core starten¶
nf-core ist eine weltweite gemeinschaftliche Initiative zur Entwicklung standardisierter Open-Source-Pipelines für eine Vielzahl wissenschaftlicher Forschungsanwendungen. Das Projekt umfasst über 100 Pipelines, die sofort einsatzbereit sind, und weit über 1400 Process-Module, die in deine eigenen Projekte integriert werden können, sowie ein umfangreiches Set an Tools für die Entwicklung.
Der Trainingskurs Hello nf-core führt dich in die von der Community kuratierten Pipelines und das Entwicklungs-Framework von nf-core ein, die entwickelt wurden, um dir beim Schreiben reproduzierbarer, skalierbarer und standardisierter Workflows zu helfen. Du lernst, wie du bestehende nf-core-Pipelines verwendest, zu ihrer Entwicklung beiträgst und sogar mit dem Aufbau eigener Pipelines beginnst – unterstützt durch Best Practices und eine lebendige Community. Wenn du bereit bist, deine Nextflow-Kenntnisse in realen Projekten anzuwenden, ist dies der perfekte nächste Schritt.
1.3. Fortgeschrittene Nextflow-Features meistern¶
In den Hello-Kursen halten wir die technische Komplexität absichtlich niedrig, um dich nicht mit Informationen zu überlasten, die du nicht benötigst, um mit Nextflow zu starten. Wenn du mit deiner Arbeit voranschreitest, wirst du lernen wollen, wie du den vollen Funktionsumfang und die Leistungsfähigkeit von Nextflow nutzt.
Zu diesem Zweck arbeiten wir derzeit an einer Sammlung von Side Quests, die als kurze eigenständige Kurse konzipiert sind, die tief in spezifische Themen wie Testing und Metadaten-Handling eintauchen.
2. Schau dir Seqera Platform an¶
Seqera Platform ist der beste Weg, Nextflow in der Praxis auszuführen.
Es ist eine cloudbasierte Plattform, die vom Nextflow-Entwicklungsteam entwickelt wurde und die du mit deiner eigenen Recheninfrastruktur (ob lokal, HPC oder Cloud) verbinden kannst, um das Starten und Verwalten deiner Workflows erheblich zu erleichtern sowie deine Daten zu verwalten und Analysen interaktiv in einer Cloud-Umgebung durchzuführen.
Das Free Tier ist für jeden kostenlos nutzbar (mit Nutzungskontingenten). Qualifizierte Akademiker können kostenlosen Zugang auf Pro-Level (ohne Nutzungsbeschränkungen) über das Academic Program erhalten.
Wirf einen Blick auf die Seqera Platform Tutorials, um zu sehen, ob dies für dich nützlich sein könnte.
Das war's für jetzt!¶
Viel Erfolg mit Nextflow! Zögere nicht, uns im Community-Forum mitzuteilen, was wir sonst noch tun könnten.