Resumen del curso¶
Traducción asistida por IA - más información y sugerencias
¡Felicitaciones por completar el curso de entrenamiento Hello nf-core! 🎉
Tu recorrido¶
Comenzaste aprendiendo a recuperar y ejecutar un pipeline de demostración, luego abordaste la conversión de un workflow simple de Nextflow en un pipeline de nf-core. Aprendiste cómo crear una estructura de pipeline usando una plantilla e injertaste el pipeline existente en esa estructura. Luego refinaste gradualmente el pipeline reemplazando uno de los módulos locales con un módulo de nf-core, transformaste otro de los módulos locales para ajustarse a los estándares de nf-core y agregaste validación de entrada.
Lo que construiste¶
Tu pipeline final core-hello ahora tiene:
- Estructura estandarizada usando la plantilla de nf-core con directorios organizados para workflows, subworkflows, módulos y configuración
- Módulos de la comunidad del repositorio de nf-core (
cat/cat) junto con tus módulos personalizados - Validación integral que verifica tanto los parámetros como los datos de entrada antes de que el pipeline se ejecute
- Configuración profesional con perfiles para diferentes entornos de ejecución
- Documentación completa y metadatos siguiendo las convenciones de nf-core
Habilidades clave adquiridas¶
A través de este curso práctico, has aprendido a:
- Navegar y comprender la estructura de pipelines de nf-core explorando un pipeline existente
- Reestructurar workflows para que sean componibles y se ajusten dentro de la plantilla de nf-core
- Encontrar e integrar módulos preconstruidos del repositorio de la comunidad
- Crear módulos personalizados siguiendo los estándares de nf-core para nomenclatura, estructura y metadatos
- Implementar validación usando nf-schema para detectar errores temprano con retroalimentación clara
Ahora estás equipado con el conocimiento fundamental para construir pipelines de nf-core listos para producción que siguen las mejores prácticas de la comunidad.
Próximos pasos para desarrollar tus habilidades¶
Aquí están nuestras 3 principales sugerencias para lo que puedes hacer a continuación:
- Aplica Nextflow a un caso de uso de análisis científico con Nextflow para Ciencia
- Explora características más avanzadas de Nextflow con las Misiones Secundarias
- Involúcrate uniéndote a la comunidad de nf-core.
Finalmente, te recomendamos que eches un vistazo a Seqera Platform, una plataforma basada en la nube desarrollada por los creadores de Nextflow que hace aún más fácil lanzar y gestionar tus workflows, así como administrar tus datos y ejecutar análisis de forma interactiva en cualquier entorno.
Encuesta de retroalimentación¶
Antes de continuar, ¡por favor tómate un minuto para completar la encuesta del curso! Tu retroalimentación nos ayuda a mejorar nuestros materiales de entrenamiento para todos.