Formazione Nextflow¶
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Corsi self-service
Benvenuti nel portale di formazione della community Nextflow!
I corsi di formazione elencati di seguito sono progettati per essere utilizzati come risorse self-service. È possibile seguirli autonomamente in qualsiasi momento, sia nell'ambiente web che forniamo tramite Github Codespaces, sia nel proprio ambiente locale.
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Informazioni aggiuntive
Compatibilità delle versioni
A partire da gennaio 2026, tutti i nostri corsi di formazione Nextflow richiedono Nextflow versione 25.10.2 o successiva, con la sintassi strict attivata, salvo diversa indicazione.
Per maggiori informazioni sui requisiti di versione e sulla sintassi strict, consultare la guida alla migrazione nella documentazione Nextflow.
Le versioni precedenti del materiale formativo corrispondenti alla sintassi precedente sono disponibili tramite il selettore di versione nella barra del menu di questa pagina web.
Opzioni per l'ambiente
Forniamo un ambiente di formazione basato sul web dove tutto il necessario per seguire la formazione è preinstallato, disponibile tramite Github Codespaces (richiede un account GitHub gratuito).
Se questa opzione non soddisfa le vostre esigenze, consulti le altre Opzioni per l'ambiente.
Eventi formativi
Se preferisce seguire la formazione Nextflow come parte di un evento strutturato, ci sono molte opportunità per farlo. vi consigliamo di esplorare le seguenti opzioni:
- Training Weeks organizzate trimestralmente dal team Community
- Seqera Events includono eventi formativi in presenza organizzati da Seqera (cercare 'Seqera Sessions' e 'Nextflow Summit')
- Nextflow Ambassadors organizzano eventi per le loro community locali
- nf-core events includono hackathon della community
Informazioni per i formatori
Se siete un formatore che organizza le proprie sessioni di formazione, siete liberi di utilizzare i nostri materiali direttamente dal portale di formazione, a condizione di attribuire il corretto credito. Vedere 'Crediti e contributi' di seguito per i dettagli.
Inoltre, ci piacerebbe ricevere il vostro feedback su come potremmo supportare meglio i vostri sforzi formativi! Vi preghiamo di contattarci all'indirizzo community@seqera.io o sul forum della community (vedere la pagina Aiuto).
Licenza open-source e politica sui contributi
Questo materiale formativo è sviluppato e mantenuto da Seqera e rilasciato con una licenza open-source (CC BY-NC-SA) a beneficio della community. Se desiderate utilizzare questo materiale in un modo che non rientra nell'ambito della licenza (si noti le limitazioni sull'uso commerciale e la redistribuzione), Vi preghiamo di contattarci all'indirizzo community@seqera.io per discutere la vostra richiesta.
Accogliamo con piacere miglioramenti, correzioni e segnalazioni di bug dalla community. Ogni pagina ha un'icona in alto a destra che collega al repository del codice, dove è possibile segnalare problemi o proporre modifiche al materiale sorgente della formazione tramite una pull request. Consultare il
README.mdnel repository per maggiori dettagli.
Traduzione assistita da IA
Questa traduzione è stata creata utilizzando l'intelligenza artificiale e revisionata da traduttori umani. Apprezziamo il tuo feedback e i tuoi suggerimenti per miglioramenti. Consulta la nostra guida alla traduzione per maggiori informazioni.
Catalogo dei corsi di formazione Nextflow¶
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Percorso introduttivo
Nextflow per principianti¶
Corsi indipendenti dal dominio applicativo, pensati per chi è completamente nuovo a Nextflow. Ogni corso consiste in una serie di moduli formativi progettati per aiutare gli studenti a sviluppare le proprie competenze progressivamente.
Hello Nextflow: Impara a sviluppare le tue pipeline
Questo corso copre i componenti fondamentali del linguaggio Nextflow con sufficiente dettaglio per consentire lo sviluppo di pipeline semplici ma pienamente funzionanti, oltre agli elementi chiave della progettazione, sviluppo e configurazione delle pipeline.
Nextflow Run: Impara a eseguire pipeline esistenti
Un'introduzione concisa all'esecuzione e alla configurazione di pipeline Nextflow, basata sul corso Hello Nextflow per sviluppatori ma con meno enfasi sul codice. Copre esecuzione, output, struttura di base del codice e configurazione per diversi ambienti di calcolo.
Nextflow per la Scienza¶
Impara ad applicare i concetti e i componenti presentati in 'Hello Nextflow' a casi d'uso scientifici specifici.
Nextflow per la Genomica (variant calling)
Per i ricercatori che desiderano imparare a sviluppare le proprie pipeline genomiche. Il corso utilizza un caso d'uso di variant calling per dimostrare come sviluppare una pipeline genomica semplice ma funzionale.
Nextflow per RNAseq (bulk RNAseq)
Per i ricercatori che desiderano imparare a sviluppare le proprie pipeline RNAseq. Il corso utilizza un caso d'uso di elaborazione bulk RNAseq per dimostrare come sviluppare una pipeline RNAseq semplice ma funzionale.
Nextflow per l'Imaging (spatial omics)
Per i ricercatori in imaging e spatial omics che desiderano imparare a eseguire e personalizzare pipeline di analisi. Il corso utilizza la pipeline nf-core/molkart per fornire una pipeline biologicamente rilevante e dimostrare come eseguire, configurare e gestire gli input per i workflow Nextflow.
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Percorso avanzato
Da Nextflow a nf-core¶
Impara a utilizzare il codice e le best practice del progetto community nf-core.
Questi corsi aiutano a passare dai fondamenti di Nextflow alle best practice di nf-core. Comprenda come e perché la community nf-core costruisce le pipeline, e come contribuire e riutilizzare queste tecniche.
Hello nf-core: Inizia con nf-core
Per gli sviluppatori che desiderano imparare a eseguire e sviluppare pipeline conformi a nf-core. Il corso copre la struttura delle pipeline nf-core con sufficiente dettaglio per consentire lo sviluppo di pipeline semplici ma pienamente funzionali che seguono il template nf-core e le best practice di sviluppo, oltre all'utilizzo dei moduli nf-core esistenti.
Formazione Nextflow Avanzata¶
Impara concetti e meccanismi avanzati per sviluppare e distribuire pipeline Nextflow per affrontare casi d'uso reali.
Side Quests: Approfondimenti su argomenti specifici
Mini-corsi indipendenti pensati per sviluppatori Nextflow che desiderano ampliare il proprio raggio d'azione e/o approfondire le proprie competenze su argomenti particolari. Sono presentati in modo lineare ma possono essere seguiti in qualsiasi ordine (vedere le dipendenze nella panoramica di ogni mini-corso).
Training Collections: Percorsi di apprendimento consigliati attraverso le Side Quests
Le Training Collections combinano più Side Quests per fornire un'esperienza di apprendimento completa su un tema o caso d'uso particolare.
Cerchi materiali formativi archiviati?
I materiali formativi più vecchi (Fundamentals Training, Advanced Training e altri corsi sperimentali) sono stati rimossi dal portale di formazione in quanto incompatibili con la sintassi strict di Nextflow 3.0. Se hai bisogno di accedere a questi materiali, sono disponibili nella cronologia git prima di gennaio 2026.
