Opzioni per l'ambiente¶
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Il nostro obiettivo è fornire un ambiente coerente e accuratamente testato che permetta ai partecipanti di concentrarsi sull'apprendimento di Nextflow senza dover dedicare tempo e sforzi alla gestione del software. A tal fine, abbiamo sviluppato un ambiente containerizzato che contiene tutto il software necessario, i file di codice e i dati di esempio per lavorare attraverso tutti i nostri corsi.
Questo ambiente containerizzato può essere eseguito direttamente su GitHub Codespaces o localmente in VS Code con l'estensione Devcontainers.
- Github Codespaces
GitHub Codespaces è un servizio basato sul web che ci permette di fornire un ambiente preconfigurato per la formazione, con tutti gli strumenti e i dati inclusi, supportato da macchine virtuali nel cloud. È accessibile gratuitamente a chiunque abbia un account Github.
- Devcontainers Locali
VS Code con Devcontainers fornisce un ambiente di sviluppo containerizzato eseguito localmente con tutti gli strumenti di formazione preconfigurati. Offre lo stesso ambiente preconfigurato di Codespaces ma funziona interamente sul vostro hardware locale.
Istruzioni per l'installazione manuale¶
Se nessuna delle opzioni sopra soddisfa le vostre esigenze, potete replicare questo ambiente sul vostro sistema locale installando manualmente le dipendenze software e clonando il repository della formazione.
Deprecazione di Gitpod
Nextflow Training utilizzava Gitpod fino a febbraio 2025. Tuttavia, i creatori di Gitpod hanno deciso di ritirare la funzionalità gratuita a favore del sistema Gitpod Flex. Per questo motivo, siamo passati all'utilizzo di GitHub Codespaces, che offre anch'esso un ambiente di sviluppo con un solo clic senza configurazione preliminare.
A seconda di quando si è registrato su Gitpod e di quando esattamente verrà ritirato il servizio, potrebbe ancora essere in grado di avviare la formazione nel loro vecchio IDE cloud, anche se non possiamo garantire un accesso affidabile in futuro: Apri in Gitpod.