Prossimi Passi¶
Traduzione assistita da IA - scopri di più e suggerisci miglioramenti
Congratulazioni ancora per aver completato il corso di formazione Nextflow per RNAseq e grazie per aver completato il nostro questionario!
1. I 3 modi migliori per migliorare le sue competenze in Nextflow¶
Ecco le nostre tre raccomandazioni principali su cosa fare dopo, basate sul corso che ha appena completato.
1.1. Applicare Nextflow ad altri casi d'uso di analisi scientifica¶
Consulti la pagina Nextflow for Science per un elenco di altri brevi corsi autonomi che dimostrano come applicare i concetti e i meccanismi di base presentati in Hello Nextflow a casi d'uso comuni di analisi scientifica.
Se non vede il suo dominio rappresentato da un caso d'uso pertinente, fatecelo sapere nel Forum della Community così potremo aggiungerlo alla nostra lista di sviluppo.
1.2. Iniziare con nf-core¶
nf-core è uno sforzo collaborativo mondiale per sviluppare pipeline open-source standardizzate per un'ampia gamma di applicazioni di ricerca scientifica. Il progetto include oltre 100 pipeline disponibili per l'uso immediato e ben oltre 1400 moduli di processo che possono essere integrati nei suoi progetti, oltre a un ricco set di strumenti per sviluppatori.
Il corso di formazione Hello nf-core la introdurrà alle pipeline curate dalla community nf-core e al framework di sviluppo, progettato per aiutarla a scrivere workflow riproducibili, scalabili e standardizzati. Imparerà come utilizzare le pipeline nf-core esistenti, contribuire al loro sviluppo e persino iniziare a costruire le sue, supportato da best practice e da una community vivace. Se è pronto ad applicare le sue competenze Nextflow in progetti del mondo reale, questo è il passo successivo perfetto.
1.3. Padroneggiare funzionalità più avanzate di Nextflow¶
Nei corsi Hello, manteniamo intenzionalmente basso il livello di complessità tecnica per evitare di sovraccaricarla con informazioni non necessarie per iniziare con Nextflow. Man mano che procede con il suo lavoro, vorrà imparare come utilizzare l'intero set di funzionalità e la potenza di Nextflow.
A tal fine, stiamo attualmente lavorando a una raccolta di Side Quests, che sono pensati come brevi corsi autonomi che approfondiscono argomenti specifici come il testing e la gestione dei metadati.
2. Scopra Seqera Platform¶
Seqera Platform è il modo migliore per eseguire Nextflow nella pratica.
È una piattaforma basata su cloud sviluppata dai creatori di Nextflow che potete connettere alla sua infrastruttura di calcolo (sia locale, HPC o cloud) per rendere molto più semplice lanciare e gestire i suoi workflow, nonché gestire i suoi dati ed eseguire analisi in modo interattivo in un ambiente cloud.
Il Free Tier è disponibile per l'uso gratuito da parte di tutti (con quote di utilizzo). Gli accademici qualificati possono ottenere accesso gratuito a livello Pro (senza limitazioni di utilizzo) attraverso l'Academic Program.
Dia un'occhiata ai tutorial di Seqera Platform per vedere se questo potrebbe esserle utile.
Per ora è tutto!¶
Buona fortuna nel suo percorso con Nextflow e non esitate a farci sapere nel Forum della Community cos'altro potremmo fare per aiutarla.