교육 과정 요약¶

Hello nf-core 교육 과정을 완료하신 것을 축하드립니다! 🎉

학습 여정¶

데모 pipeline을 가져와서 실행하는 방법을 배우는 것으로 시작하여, 간단한 Nextflow workflow를 nf-core pipeline으로 변환하는 작업을 수행하셨습니다. template을 사용하여 pipeline scaffold를 생성하는 방법을 배우고 기존 pipeline을 해당 scaffold에 접목시켰습니다. 그런 다음 local module 중 하나를 nf-core module로 교체하고, 다른 local module을 nf-core 표준에 맞게 변환하며, 입력 검증을 추가하여 pipeline을 단계적으로 개선하셨습니다.

구축한 결과물¶

최종 core-hello pipeline은 다음을 갖추고 있습니다:

표준화된 구조: nf-core template을 사용하여 workflow, subworkflow, module 및 구성을 위한 체계적인 디렉토리 구조
커뮤니티 module: nf-core 저장소의 module(cat/cat)과 함께 사용자 정의 module
포괄적인 검증: pipeline 실행 전에 매개변수와 입력 데이터를 모두 확인
전문적인 구성: 다양한 실행 환경을 위한 프로파일
완전한 문서화: nf-core 규칙을 따르는 메타데이터

습득한 핵심 기술¶

이 실습 교육 과정을 통해 다음을 배우셨습니다:

기존 pipeline을 탐색하여 nf-core pipeline 구조를 탐색하고 이해하기
nf-core template 내에서 조합 가능하도록 workflow를 재구성하기
커뮤니티 저장소에서 사전 구축된 module을 찾아서 통합하기
명명, 구조 및 메타데이터에 대한 nf-core 표준을 따라 사용자 정의 module 생성하기
nf-schema를 사용하여 명확한 피드백으로 오류를 조기에 발견하는 검증 구현하기

이제 커뮤니티 모범 사례를 따르는 프로덕션 준비가 된 nf-core pipeline을 구축하기 위한 기초 지식을 갖추셨습니다.

기술 향상을 위한 다음 단계¶

다음 단계로 추천하는 상위 3가지 사항입니다:

Nextflow for Science를 통해 과학적 분석 사용 사례에 Nextflow 적용하기
Side Quests를 통해 더 고급 Nextflow 기능 탐색하기
nf-core 커뮤니티 참여를 통해 참여하기

마지막으로, Nextflow 제작자들이 개발한 클라우드 기반 플랫폼인 Seqera Platform을 살펴보시길 권장합니다. 이 플랫폼을 사용하면 workflow를 더 쉽게 시작하고 관리할 수 있으며, 데이터를 관리하고 모든 환경에서 대화형으로 분석을 실행할 수 있습니다.

피드백 설문조사¶

다음 단계로 넘어가기 전에, 교육 과정 설문조사를 작성하는 데 1분만 투자해 주십시오! 여러분의 피드백은 모두를 위한 교육 자료를 개선하는 데 도움이 됩니다.

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