Przejdź do treści

Ręczna instalacja

Tłumaczenie wspomagane przez AI - dowiedz się więcej i zasugeruj ulepszenia

Możliwe jest ręczne zainstalowanie wszystkiego, czego potrzebujesz do uruchomienia szkolenia w Twoim własnym lokalnym środowisku.

Tutaj udokumentowaliśmy, jak to zrobić na standardowych systemach zgodnych z POSIX (zakładając komputer osobisty, taki jak laptop). Pamiętaj, że niektóre szczegóły mogą się różnić w zależności od Twojego konkretnego systemu.

Wskazówka

Zanim przejdziesz dalej, czy rozważyłeś użycie podejścia Devcontainers? Zapewnia ono wszystkie niezbędne narzędzia i zależności bez konieczności ręcznej instalacji.

Ogólne wymagania programowe

Nextflow może być używany na dowolnym systemie zgodnym z POSIX (Linux, macOS, Windows Subsystem for Linux itp.) z zainstalowaną Javą. Nasze kursy szkoleniowe mają kilka dodatkowych wymagań.

W sumie będziesz potrzebować następującego oprogramowania:

Aplikacja VSCode jest technicznie opcjonalna, ale zdecydowanie zalecamy jej użycie zarówno do pracy z kursami, jak i do ogólnej pracy z Nextflow.

Podręcznik dokumentacji Nextflow zawiera instrukcje instalacji tych zależności w sekcji Environment setup.

Nextflow i narzędzia nf-core

Będziesz musiał zainstalować sam Nextflow oraz narzędzia nf-core, jak opisano w artykułach podlinkowanych poniżej:

Zalecamy użycie opcji samoinstalacji dla Nextflow i opcji PyPI dla narzędzi nf-core.

Kompatybilność wersji

Od stycznia 2026 roku wszystkie nasze kursy szkoleniowe Nextflow wymagają wersji Nextflow 25.10.2 lub nowszej, z włączoną ścisłą składnią v2, chyba że zaznaczono inaczej.

Więcej informacji o wymaganiach wersji i ścisłej składni v2 znajdziesz w przewodniku Wersje Nextflow.

Starsze wersje materiałów szkoleniowych odpowiadające wcześniejszej składni są dostępne poprzez selektor wersji w pasku menu tej strony.

Materiały szkoleniowe

Najprostszym sposobem pobrania materiałów szkoleniowych jest sklonowanie całego repozytorium za pomocą tego polecenia:

git clone https://github.com/nextflow-io/training.git

Każdy kurs ma swój własny katalog. Aby rozpocząć pracę, otwórz okno terminala (najlepiej z poziomu aplikacji VSCode) i przejdź za pomocą cd do odpowiedniego katalogu.

Następnie możesz postępować zgodnie z instrukcjami kursu dostarczonymi na stronie internetowej.