Następne kroki¶
Tłumaczenie wspomagane przez AI - dowiedz się więcej i zasugeruj ulepszenia
Gratulujemy ponownie ukończenia kursu szkoleniowego Nextflow For Genomics i dziękujemy za wypełnienie naszej ankiety!
1. Top 3 sposoby na podniesienie umiejętności Nextflow¶
Oto nasze trzy najlepsze rekomendacje dotyczące kolejnych kroków, oparte na kursie, który właśnie ukończyłeś.
1.1. Zastosuj Nextflow do innych przypadków użycia w analizie naukowej¶
Sprawdź stronę Nextflow for Science, aby zobaczyć listę innych krótkich, samodzielnych kursów, które pokazują, jak zastosować podstawowe koncepcje i mechanizmy przedstawione w Hello Nextflow do typowych przypadków użycia w analizie naukowej.
Jeśli nie widzisz Swojej dziedziny reprezentowanej przez odpowiedni przypadek użycia, daj nam znać na forum społeczności, abyśmy mogli dodać ją do naszej listy rozwojowej.
1.2. Zacznij pracę z nf-core¶
nf-core to ogólnoświatowy wysiłek współpracy mający na celu opracowanie standaryzowanych pipeline'ów open-source dla szerokiego zakresu zastosowań w badaniach naukowych. Projekt obejmuje ponad 100 pipeline'ów, które są dostępne do użycia od razu, oraz ponad 1400 modułów procesów, które można zintegrować z własnymi projektami, a także bogaty zestaw narzędzi deweloperskich.
Kurs szkoleniowy Hello nf-core wprowadzi Cię w pipeline'y kuratorowane przez społeczność nf-core oraz framework deweloperski, zaprojektowane, aby pomóc Ci pisać powtarzalne, skalowalne i standaryzowane workflow. Nauczysz się, jak używać istniejących pipeline'ów nf-core, przyczyniać się do ich rozwoju, a nawet rozpocząć budowanie własnych, wspieranych przez najlepsze praktyki i żywą społeczność. Jeśli jesteś gotowy, aby zastosować Swoje umiejętności Nextflow w rzeczywistych projektach, to jest idealny następny krok.
1.3. Opanuj bardziej zaawansowane funkcje Nextflow¶
W kursach Hello celowo utrzymujemy niski poziom złożoności technicznej, aby nie przeciążać Cię informacjami, których nie potrzebujesz, aby rozpocząć pracę z Nextflow. Kontynuując Swoją pracę, będziesz chciał nauczyć się, jak wykorzystać pełny zestaw funkcji i moc Nextflow.
W tym celu obecnie pracujemy nad kolekcją Side Quests, które mają być krótkimi, samodzielnymi kursami zagłębiającymi się w konkretne tematy, takie jak testowanie i zarządzanie metadanymi.
2. Sprawdź Seqera Platform¶
Seqera Platform to najlepszy sposób na uruchamianie Nextflow w praktyce.
Jest to platforma chmurowa opracowana przez twórców Nextflow, którą można połączyć z własną infrastrukturą obliczeniową (lokalną, HPC lub chmurową), aby znacznie ułatwić uruchamianie i zarządzanie workflow, a także zarządzanie danymi i przeprowadzanie analiz interaktywnie w środowisku chmurowym.
Free Tier jest dostępny do bezpłatnego użytku dla wszystkich (z limitami użytkowania). Kwalifikujący się pracownicy naukowi mogą uzyskać bezpłatny dostęp na poziomie Pro (bez ograniczeń użytkowania) poprzez Program Akademicki.
Zapoznaj się z samouczkami Seqera Platform, aby sprawdzić, czy może to być dla Ciebie przydatne.
To wszystko na razie!¶
Powodzenia na Twojej drodze z Nextflow i nie wahaj się dać nam znać na forum społeczności, co jeszcze możemy zrobić, aby pomóc.